รายละเอียดสินค้า:
- ชื่อ: ชุดตรวจจับการกลายพันธุ์ของยีน EGFR
- วัตถุประสงค์: การตรวจหาเชิงคุณภาพ 11 การกลายพันธุ์ทั่วไปในยีน EGFR ของมนุษย์.
- ตัวอย่าง: ตัวอย่าง DNA จากส่วนที่ฝังพาราฟินของผู้ป่วยที่ได้รับการวินิจฉัยทางคลินิกว่าเป็นมะเร็งปอดชนิดไม่ใช่เซลล์ขนาดเล็ก.
- การยืนยัน: ผลิตภัณฑ์ได้รับการตรวจสอบประสิทธิภาพการตรวจจับการกลายพันธุ์ของยีนเป้าหมาย แต่ไม่ได้ใช้ร่วมกับยาเฉพาะในการทดลองทางคลินิก.
การใช้และข้อจำกัด:
- ใช้: ผลการตรวจพบสามารถช่วยในการคัดกรองผู้ป่วยมะเร็งปอดชนิดไม่ใช่เซลล์ขนาดเล็กที่เหมาะสมสำหรับการรักษาที่กำหนดเป้าหมาย EGFR.
- ข้อจำกัด: ผลการตรวจจับเพียงอย่างเดียวไม่สามารถใช้เป็นพื้นฐานเพียงอย่างเดียวสำหรับการวินิจฉัยทางคลินิก.
ข้อมูลความเป็นมา:
- อีจีเอฟอาร์: ตัวรับปัจจัยการเจริญเติบโตของผิวหนังชั้นนอก, โปรตีนเมมเบรนที่สำคัญต่อการเพิ่มจำนวนเซลล์, การเจริญเติบโต, ซ่อมแซม, และการอยู่รอดของเซลล์เนื้องอก.
- โครงสร้างยีน: ตั้งอยู่บนโครโมโซม 7 (7หน้า 12~14), ยีน EGFR ประกอบด้วย 28 เอ็กซอน. เอ็กซอน 18-24 สร้างโดเมนไทโรซีนไคเนสที่เข้ารหัสยีน.
- โฟกัสการกลายพันธุ์: การกลายพันธุ์ส่วนใหญ่เกิดขึ้นในเอ็กซอน 18-21, โดยเฉพาะอย่างยิ่งเอ็กซอน 19 การลบและ exon 21 การกลายพันธุ์ของ L858R.
- ความเกี่ยวข้องทางคลินิก: การกลายพันธุ์เหล่านี้ทำนายประสิทธิภาพของยาเป้าหมายในการรักษามะเร็งปอดชนิดเซลล์ไม่เล็กและแนะนำการเลือกใช้ยารักษาเนื้องอก.
- ข้อกำหนดขององค์การอาหารและยา: การตรวจจับการกลายพันธุ์ของยีน EGFR ได้รับคำสั่งสำหรับผู้ป่วยที่กำลังพิจารณาการรักษา EGFR-TKI.
โต๊ะ 1: การกลายพันธุ์ทั่วไปของยีน EGFR
การกลายพันธุ์ | เอ็กซอน | การเปลี่ยนแปลงลำดับกรดอะมิโน | การเปลี่ยนแปลงลำดับฐาน | รหัสจักรวาล |
---|---|---|---|---|
เช่น 18-Mu-1 | 18 | G719S | 2155ช>ก | 6252 |
เช่น 18-Mu-2 | 18 | G719C | 2155ช>ต | 6253 |
เช่น 18-Mu-3 | 18 | G719A | 2156ช>ค | 6239 |
เช่น 19-Mu-1 | 19 | Glu746-Ala750del | 2235-2249ของ | 6223 |
อดีต 20-Mu-1 | 20 | S768I | 2303ช>ต | 6241 |
อดีต 20-Mu-2 | 20 | T790M | 2369ค>ต | 6240 |
เช่น 20-Mu-3 | 20 | V769-D770insASV | 2307_2308insGCCAGCGTG | 12376 |
เช่น 20-Mu-4 | 20 | H773-V774insH | 2319_2320insCAC | 12377 |
เช่น 20-Mu-5 | 20 | D770-N771insG | 2310_2311insGGT | 12378 |
เช่น 21-Mu-1 | 21 | L858R | 2573ต>ช | 6224 |
เช่น 21-Mu-2 | 21 | L861Q | 2582ต>ก | 6213 |
หลักการทดสอบ
ชุดนี้ออกแบบมาเพื่อตรวจจับการกลายพันธุ์เฉพาะในยีน EGFR. ประกอบด้วยไพรเมอร์และโพรบสำหรับการตรวจจับ:
- การกลายพันธุ์ของ G719X (G719S, G719C, G719A) ในเอ็กซอน 18,
- การลบการกลายพันธุ์ของ exon 19 (รวมถึง 2235-2249del 15),
- การกลายพันธุ์ของ S768I และ T790M ใน exon 20,
- การกลายพันธุ์ของการแทรกสามประเภท (2307_2308insGCCAGCGTG, 2319_2320insCAC, และ 2310_2311insGGT),
- การกลายพันธุ์ของ L858R และ L861Q ใน exon 21.
ระหว่างการตรวจจับการกลายพันธุ์, หากตัวอย่างมีเทมเพลต DNA ที่กลายพันธุ์:
- ไพรเมอร์และโพรบเฉพาะสำหรับการกลายพันธุ์ที่ตรวจพบจะจับกับเทมเพลต DNA.
- พีซีอาร์ การขยายเสียงจะเกิดขึ้น, ปล่อยสัญญาณเรืองแสง.
- การตรวจสอบแบบเรียลไทม์และเอาต์พุตความแรงของสัญญาณฟลูออเรสเซนซ์จะดำเนินการโดยใช้เครื่องขยายสัญญาณ PCR เชิงปริมาณฟลูออเรสเซนต์.
หากตัวอย่างไม่มีเทมเพลต DNA ที่กลายพันธุ์:
- ไพรเมอร์และโพรบเฉพาะสำหรับการกลายพันธุ์จะไม่จับกับ DNA ของเทมเพลต, มิฉะนั้นการผูกมัดจะถูกปิดกั้น.
- ซึ่งจะส่งผลให้ไม่มีการขยาย PCR หรือยับยั้งการขยาย PCR.
- เพราะเหตุนี้, จะไม่มีการปล่อยสัญญาณเรืองแสง.
โดยรวม, ชุดนี้ช่วยให้สามารถวิเคราะห์ผลการตรวจจับเชิงคุณภาพผ่านการตรวจสอบสัญญาณเรืองแสงแบบเรียลไทม์ในระหว่างการขยาย PCR.
โต๊ะ 2 ส่วนประกอบหลักของชุดคิท
หมายเลขท่อ. | ชื่อป้ายกำกับ | ส่วนผสมหลัก | ข้อกำหนดการบรรจุ (12 การทดสอบ/ชุดอุปกรณ์) | ข้อกำหนดการบรรจุ (24 การทดสอบ/ชุดอุปกรณ์) |
---|---|---|---|---|
1 | ของเหลวทำปฏิกิริยา G719X PCR | บัฟเฟอร์ PCR, dNTP, ไพรเมอร์และโพรบ G719X | 1 หลอด (290ไมโครลิตร) | 1 หลอด (580ไมโครลิตร) |
2 | S768I ของเหลวปฏิกิริยา PCR | บัฟเฟอร์ PCR, dNTP, S768I ไพรเมอร์และโพรบ | 1 หลอด (290ไมโครลิตร) | 1 หลอด (580ไมโครลิตร) |
3 | ของเหลวปฏิกิริยา PCR T790M | บัฟเฟอร์ PCR, dNTP, ไพรเมอร์และโพรบ T790M | 1 หลอด (290ไมโครลิตร) | 1 หลอด (580ไมโครลิตร) |
4 | ของเหลวปฏิกิริยา PCR L858R | บัฟเฟอร์ PCR, dNTP, ไพรเมอร์และโพรบ L858R | 1 หลอด (290ไมโครลิตร) | 1 หลอด (580ไมโครลิตร) |
5 | ของเหลวปฏิกิริยา PCR L861Q | บัฟเฟอร์ PCR, dNTP, ไพรเมอร์และโพรบ L861Q | 1 หลอด (290ไมโครลิตร) | 1 หลอด (580ไมโครลิตร) |
6 | ของเหลวปฏิกิริยา Ins PCR | บัฟเฟอร์ PCR, dNTP, อินไพรเมอร์และโพรบ | 1 หลอด (290ไมโครลิตร) | 1 หลอด (580ไมโครลิตร) |
7 | ของเหลวปฏิกิริยา Del PCR | บัฟเฟอร์ PCR, dNTP, ตั้งแต่ครั้งแรกและการสอบสวน | 1 หลอด (290ไมโครลิตร) | 1 หลอด (580ไมโครลิตร) |
8 | ของเหลวปฏิกิริยา PCR ควบคุมคุณภาพ | บัฟเฟอร์ PCR, dNTP, ไพรเมอร์และโพรบควบคุมคุณภาพ | 1 หลอด (290ไมโครลิตร) | 1 หลอด (580ไมโครลิตร) |
9 | ส่วนผสมของเอนไซม์ | ส่วนผสมเอนไซม์ที่ประกอบด้วยเอนไซม์ Taq และเอนไซม์ UNG | 1 หลอด (24ไมโครลิตร) | 1 หลอด (48ไมโครลิตร) |
10 | สีย้อมอ้างอิง | สีย้อมร็อกซ์ | 1 หลอด (45ไมโครลิตร) | 1 หลอด (90ไมโครลิตร) |
11 | เทมเพลตมาตรฐานภายใน | เทมเพลต DNA มาตรฐานภายใน | 1 หลอด (100ไมโครลิตร) | 1 หลอด (100ไมโครลิตร) |
12 | การควบคุมเชิงบวกที่อ่อนแอ | มีเทมเพลต DNA การกลายพันธุ์ | 1 หลอด (200ไมโครลิตร) | 1 หลอด (200ไมโครลิตร) |
13 | การควบคุมที่ว่างเปล่า | ทริส-HCl กันชน (10มม) | 1 หลอด (200ไมโครลิตร) | 1 หลอด (200ไมโครลิตร) |
สภาพการเก็บรักษาและอายุการเก็บรักษา:
- อายุการเก็บรักษาของชุดคือ 9 เดือนเมื่อเก็บไว้ที่ -20°C±5°C และป้องกันไม่ให้ถูกแสง.
- ลดการแช่แข็งและการละลายให้เหลือน้อยกว่า 6 ครั้งระหว่างการใช้งาน.
- วันผลิตและวันหมดอายุระบุไว้บนฉลาก.
เครื่องมือที่ใช้บังคับ:
- ชุดนี้เข้ากันได้กับ Stratagene MX3000P, เอบี 7500, และไลท์ไซเคิล 480 เครื่องขยายสัญญาณ PCR เชิงปริมาณฟลูออเรสเซนต์แบบเรียลไทม์.
- ใช้ช่อง FAM เพื่อรวบรวมสัญญาณฟลูออเรสเซนต์ของการขยายยีน EGFR, ช่อง VIC/JOE/HEX สำหรับสัญญาณขยายยีนมาตรฐานภายใน, และตั้งค่าสัญญาณอ้างอิง (ร็อกซ์).
ข้อกำหนดของตัวอย่าง:
- DNA คุณภาพสูงเป็นสิ่งสำคัญ. ชุดนี้เหมาะสำหรับการตรวจหา DNA จีโนมมนุษย์ที่สกัดจากเนื้อเยื่อพยาธิวิทยาที่ฝังพาราฟินซึ่งได้รับการยืนยันจากแพทย์ว่ามีเนื้อเยื่อเนื้องอก. ตัวอย่างภายใน 3 มีการแนะนำปี.
- ชุดสกัด DNA ของ QIAGEN (QIAamp ดีเอ็นเอ เอฟเอฟพีอี ชุดทิชชู่, หมายเลขแมว. 56404) ขอแนะนำ. ควรทดสอบความเข้มข้นและความบริสุทธิ์ของ DNA ที่สกัดด้วยเครื่องสเปกโตรโฟโตมิเตอร์ UV (OD260/OD280: 1.8-2.0). เจือจาง DNA เป็น 10-15ng/μL แล้วทดสอบทันทีหรือเก็บไว้ที่อุณหภูมิต่ำกว่า -20°C โดยไม่ต้องแช่แข็งหรือละลายซ้ำๆ.
วิธีทดสอบ:
1. การเตรียมรีเอเจนต์:
- ปล่อยให้ชุดอุปกรณ์มีอุณหภูมิห้อง, ละลายส่วนประกอบทั้งหมดจนหมด, และเครื่องปั่นแยกเพื่อ 10 วินาที.
- กำหนดจำนวนปฏิกิริยา (n) จำเป็น. เตรียมตัว 7 ชนิดของการผสมปฏิกิริยา PCR กลายพันธุ์และการควบคุมคุณภาพ การผสมปฏิกิริยา PCR ตามวิธีการที่ระบุในตารางที่ 1 3.
- n=จำนวนชิ้นงานทดสอบ+ส่วนควบคุมว่างเปล่า (1ต)+การควบคุมเชิงบวกที่อ่อนแอ (1ต)
- บรรจุหลอดที่เตรียมไว้ 1-8 ของเหลวปฏิกิริยา PCR ลงในหลอดปฏิกิริยาตามปริมาณการบรรจุ23μLต่อหลุม.
- ย้ายหลอดปฏิกิริยา PCR ไปยังพื้นที่เตรียมชิ้นงานทดสอบ. เก็บรีเอเจนต์ที่เหลือกลับเข้าไปในตู้เย็นที่อุณหภูมิ -20°C ±5°C เพื่อการแช่แข็งและป้องกันแสง.
โต๊ะ 3: วิธีการเตรียมระบบปฏิกิริยา PCR แต่ละระบบ
ส่วนประกอบ | สูตรของระบบปฏิกิริยาเดี่ยว | สูตรของระบบปฏิกิริยา n |
---|---|---|
ของเหลวปฏิกิริยา PCR | 22.3ไมโครลิตร | 22.3×n ไมโครลิตร |
ส่วนผสมของเอนไซม์ | 0.2ไมโครลิตร | 0.2×n ไมโครลิตร |
สีย้อมอ้างอิง (ร็อกซ์) | 0.4ไมโครลิตร | 0.4×n ไมโครลิตร |
เทมเพลตมาตรฐานภายใน | 0.1ไมโครลิตร | 0.1×n ไมโครลิตร |
2. การเตรียมตัวอย่าง:
(พื้นที่เตรียมตัวอย่าง)
- การสกัด DNA ของตัวอย่าง:
- ปฏิบัติตามคำแนะนำที่มาพร้อมกับชุดสกัด DNA จีโนมเชิงพาณิชย์ที่ซื้อมา.
- การเพิ่มตัวอย่าง:
- ก) เพิ่มจีโนมดีเอ็นเอ, การควบคุมเชิงบวกอย่างอ่อน, และการควบคุมชิ้นงานทดสอบเปล่าที่จะทดสอบในหลอดปฏิกิริยาที่มี 1-8 ส่วนผสมปฏิกิริยา PCR. แต่ละชิ้นงานทดสอบด้วย 8 ประเภทของส่วนผสมปฏิกิริยา PCR, ด้วยปริมาณเพิ่มเติม 2μL ต่อหลุม. ความเข้มข้นที่แนะนำของตัวอย่าง DNA คือ 10-15ng/μL.
- ข) หากไม่สามารถวางท่อปฏิกิริยา PCR ที่มีแม่แบบเพิ่มเติมไว้บนเครื่องมือได้ทันทีเนื่องจากสถานการณ์ชั่วคราว, เก็บไว้ที่อุณหภูมิ 2-8 ℃ชั่วคราวและดำเนินการตรวจจับเครื่องมือโดยเร็วที่สุดภายใน 24 ชั่วโมง.
3. การขยาย PCR:
(พื้นที่ขยายกรดนิวคลีอิก)
- สตาร์ทเครื่องมือและทำการตรวจสอบประสิทธิภาพของเครื่องมือด้วยตนเอง.
- นำหลอดปฏิกิริยา PCR ที่เตรียมไว้ในพื้นที่เตรียมตัวอย่างและวางไว้ในตำแหน่งที่สอดคล้องกันในถังตัวอย่างของเครื่องมือ. บันทึกลำดับตำแหน่ง.
- ตั้งค่าพารามิเตอร์ที่เกี่ยวข้องสำหรับการขยายกรดนิวคลีอิกตามตาราง 4 และเริ่มการขยาย PCR. หลังจากปฏิกิริยาเสร็จสิ้น, กำหนดเกณฑ์การเรืองแสงที่เหมาะสม (โดยทั่วไปคั่นกลางระยะการเติบโตแบบเอ็กซ์โปเนนเชียลภายใต้รูปแบบลอการิทึมของเส้นโค้งการขยาย) เพื่อรับค่า Ct สำหรับช่องต่างๆ และคำนวณค่า △Ct ที่เกี่ยวข้องตามเส้นโค้งการขยาย.
โต๊ะ 4: พารามิเตอร์ที่เกี่ยวข้องของการขยายกรดนิวคลีอิกของเครื่องมือ
เงื่อนไขปฏิกิริยา PCR | เฟส | เงื่อนไข | จำนวนรอบ |
---|---|---|---|
การรักษาด้วยอึ้ง | 37℃ | 10 นาที (นาที) | 1 |
ก่อนการเสื่อมสภาพ | 95℃ | 5 นาที (นาที) | 1 |
พีซีอาร์ | 95℃ | 15 วินาที (ส) | 40 |
60℃ | 60 วินาที (ส) | ||
(สัญญาณเรืองแสงที่รวบรวมเมื่อสิ้นสุดเฟสนี้) |
การรับสัญญาณ:
- ยีน EGFR: สัญญาณเรืองแสงจะถูกรวบรวมจากช่อง FAM.
- ยีนมาตรฐานภายใน: สัญญาณเรืองแสงจะถูกรวบรวมจากช่อง HEX/VIC/JOE.
การวิเคราะห์ผลลัพธ์:
หลังจากทำปฏิกิริยาเสร็จแล้ว, เกณฑ์ถูกตั้งค่าตามเส้นโค้งการขยายเพื่อคำนวณ △Ct (△Ct = การตรวจจับการกลายพันธุ์ Ct – การตรวจสอบการควบคุมคุณภาพกะรัต) และตีความผลลัพธ์.
การตีความผลการทดสอบ:
1. การกำหนดประสิทธิผลของชุดอุปกรณ์:
- การควบคุมเชิงบวกที่อ่อนแอ:
- ค่า Ct ของช่อง FAM คือ ≤32 โดยมีระยะการเติบโตแบบเอ็กซ์โพเนนเชียลที่ชัดเจนในกราฟการขยายสัญญาณ.
- การควบคุมที่ว่างเปล่า:
- ช่อง FAM ไม่แสดงเส้นโค้งการขยายสัญญาณหรือเส้นตรงหรือเส้นเฉียงเล็กน้อย. ไม่มีระยะการเติบโตแบบทวีคูณที่ชัดเจน, ค่ากะรัตคือ ≥38.
- ยีนมาตรฐานภายใน:
- อยู่ในการควบคุมที่ว่างเปล่า, ค่า Ct ของช่อง HEX/VIC/JOE คือ <38 ด้วยระยะการเติบโตแบบทวีคูณที่ชัดเจน.
- ในตัวอย่างที่ทดสอบและหลอดปฏิกิริยาบวกอย่างอ่อน, การขาดสัญญาณเป็นครั้งคราวในช่อง HEX/VIC/JOE เมื่อช่อง FAM มีสัญญาณอาจเกิดขึ้นเนื่องจากการยับยั้งการขยายมาตรฐานภายในโดยการขยายยีนเป้าหมาย.
2. การกำหนดประสิทธิผลของชิ้นงานทดสอบ:
- ของเหลวปฏิกิริยา PCR ควบคุมคุณภาพ:
- สำหรับช่อง FAM, กะรัต < 23, บ่งชี้ถึงการให้ยาเกินขนาดของจีโนม DNA ของตัวอย่าง. แนะนำให้ทำการทดสอบซ้ำหลังจากการเจือจาง.
- ของเหลวปฏิกิริยา PCR ควบคุมคุณภาพ:
- สำหรับช่อง FAM, 23 ≤ กะรัต ≤ 30, บ่งชี้ปริมาณ DNA ของตัวอย่างจีโนมในระดับปานกลาง.
- ของเหลวปฏิกิริยา PCR ควบคุมคุณภาพ:
- สำหรับช่อง FAM, 30 < กะรัต < 34, บ่งชี้ปริมาณ DNA ของตัวอย่างจีโนมที่ต่ำกว่า. ประเภทการกลายพันธุ์สามารถทดสอบได้เฉพาะในตัวอย่างที่มีปริมาณ DNA การกลายพันธุ์สูงกว่าเท่านั้น.
- ของเหลวปฏิกิริยา PCR ควบคุมคุณภาพ:
- สำหรับช่อง FAM, กะรัต ≥ 34, บ่งชี้ว่าปริมาณการเพิ่มของจีโนม DNA ของตัวอย่างต่ำเกินไป. ต้องมีการเตรียมตัวอย่างใหม่หรือเพิ่มปริมาณการใช้งานเพื่อการตรวจจับ.
3. การกำหนดผลการตรวจจับ:
หลังจากพิจารณาประสิทธิภาพการตรวจจับแล้ว, คำนวณค่า △Ct ของชิ้นงานการตรวจจับที่มีประสิทธิผล และกำหนดผลการตรวจจับตามขั้นตอนและตารางต่อไปนี้ 5 เพื่อยืนยันการมีอยู่ของการกลายพันธุ์ในตัวอย่าง.
- ในการตรวจจับการกลายพันธุ์ของสิ่งส่งตรวจ, มูลค่ากะรัต > 36 บ่งชี้ว่าชิ้นงานทดสอบมีค่าลบหรือต่ำกว่าขีดจำกัดการตรวจจับล่างของชุดอุปกรณ์นี้.
- ในการตรวจจับการกลายพันธุ์ของสิ่งส่งตรวจ, ถ้าค่า Ct เท่ากับ ≤ 36, คำนวณค่า △Ct ของหลอดปฏิกิริยานี้. หากค่า △Ct น้อยกว่าค่าจุดตัด △Ct ที่สอดคล้องกัน, ตัวอย่างนั้นถือว่ามีการกลายพันธุ์เป็นบวก. มิฉะนั้น, จะถือว่าการกลายพันธุ์เป็นลบหรือต่ำกว่าขีดจำกัดการตรวจจับล่างของชุดอุปกรณ์นี้.
- การใช้เกณฑ์การพิจารณาข้างต้น, ประเภทการกลายพันธุ์ของตัวอย่างที่เป็นบวกของ G719X อาจเป็นหนึ่งใน G719S, G719C, และ G719A. ประเภทการกลายพันธุ์ของตัวอย่างเชิงบวกของ Ins อาจเป็นหนึ่งใน V769-D770insASV, H773-V774insH, และ D770-N771insG. สินค้านี้ไม่สามารถแบ่งแยกได้อีก.
โต๊ะ 5: การกำหนดผลลัพธ์
ของเหลวปฏิกิริยา | ประเภทการกลายพันธุ์ | เชิงลบ | เชิงบวก |
---|---|---|---|
ของเหลวทำปฏิกิริยา G719X PCR | G719X | กะรัต > 36 หรือไม่มีค่า Ct | กะรัต ≤ 36, ∆Ct ≥ 7 |
S768I ของเหลวปฏิกิริยา PCR | S768I | กะรัต > 36 หรือไม่มีค่า Ct | กะรัต ≤ 36, ∆Ct ≥ 7 |
ของเหลวปฏิกิริยา PCR T790M | T790M | กะรัต > 36 หรือไม่มีค่า Ct | กะรัต ≤ 36, ∆Ct ≥ 7 |
ของเหลวปฏิกิริยา PCR L858R | L858R | กะรัต > 36 หรือไม่มีค่า Ct | กะรัต ≤ 36, ∆Ct ≥ 7 |
ของเหลวปฏิกิริยา PCR L861Q | L861Q | กะรัต > 36 หรือไม่มีค่า Ct | กะรัต ≤ 36, ∆Ct ≥ 7 |
ของเหลวปฏิกิริยา Ins PCR | อิน | กะรัต > 36 หรือไม่มีค่า Ct | กะรัต ≤ 36, ∆Ct ≥ 6 |
ของเหลวปฏิกิริยา Del PCR | ของ | กะรัต > 36 หรือไม่มีค่า Ct | กะรัต ≤ 36, ∆Ct ≥ 6 |
ข้อจำกัดของวิธีทดสอบ:
- ความแม่นยำของผลการตรวจจับชิ้นงานขึ้นอยู่กับคุณภาพของการเก็บตัวอย่าง, การรักษา, และการจัดเก็บ. ข้อผิดพลาดในกระบวนการเหล่านี้อาจนำไปสู่ผลลัพธ์การตรวจจับที่ไม่ถูกต้อง. คุณภาพ DNA ที่ไม่ดีในระหว่างการรักษาสิ่งส่งตรวจอาจส่งผลให้เกิดผลลบลวง. สำหรับช่อง FAM ของของเหลวปฏิกิริยา PCR ควบคุมคุณภาพ, ตัวอย่างที่มีค่า Ct ระหว่าง 23 และ 30 บ่งบอกถึงคุณภาพ DNA ที่ค่อนข้างดีและการเติมตัวอย่างในระดับปานกลาง, ส่งผลให้ผลการตรวจจับแม่นยำที่สุด.
- ผลลัพธ์เชิงลบที่ได้จากการตรวจจับสิ่งส่งตรวจไม่สามารถแยกแยะการมีอยู่ของการกลายพันธุ์ที่มีความอุดมสมบูรณ์ต่ำหรือการกลายพันธุ์ในตำแหน่งอื่นของยีน EGFR.
- ผลการตรวจจับของชุดอุปกรณ์นี้มีจุดประสงค์เพื่อใช้อ้างอิงทางคลินิกเพื่อเป็นแนวทางในการใช้ยาเฉพาะบุคคล และไม่ควรใช้เป็นพื้นฐานเพียงอย่างเดียวสำหรับการวินิจฉัยทางคลินิก.
ดัชนีประสิทธิภาพของผลิตภัณฑ์:
- ชุดนี้บรรจุเต็มโดยไม่มีเนื้อหาล้น. ฉลากมีเนื้อหาระบุตัวตนที่ชัดเจน. องค์ประกอบของชุดอุปกรณ์ถูกต้องโดยไม่ต้องทำซ้ำหรือส่วนประกอบขาดหายไป.
- ตรวจพบการอ้างอิงเฉพาะโดยใช้ 7 ประเภทของของเหลวปฏิกิริยาการกลายพันธุ์ที่รวมอยู่ในชุดอุปกรณ์, และผลการตรวจจับทั้งหมดเป็นลบ.
- ตรวจพบความไวของการกลายพันธุ์ที่สอดคล้องกันโดยใช้ 7 ประเภทของของเหลวปฏิกิริยาการกลายพันธุ์ที่รวมอยู่ในชุดอุปกรณ์, และผลการตรวจจับทั้งหมดเป็นบวก.
- ขีดจำกัดต่ำสุดของการตรวจจับสามารถเข้าถึงได้ 1%, ช่วยให้สามารถตรวจจับการกลายพันธุ์ของยีน EGFR ประเภทต่างๆ ใน DNA จีโนม 20ng.
- ชุดนี้ใช้เพื่อตรวจจับการอ้างอิงที่แม่นยำของยีน EGFR ซ้ำๆ 10 ครั้ง, ด้วยค่าสัมประสิทธิ์การแปรผันภายในการทดสอบ (ประวัติย่อ) ของ ≤5%.
ข้อควรระวัง:
- ชุดนี้มีไว้สำหรับการวินิจฉัยภายนอกร่างกายเท่านั้น.
- อย่าผสมรีเอเจนต์จากชุดอุปกรณ์นี้กับรีเอเจนต์จากล็อตอื่น.
- การควบคุมเชิงบวกเล็กน้อยในชุดอุปกรณ์นี้ไม่ติดต่อ แต่ควรได้รับการจัดการเนื่องจากวัสดุที่อาจติดเชื้อได้.
- รีเอเจนต์ที่ตกค้างในชุดอุปกรณ์และของเสียจากการทดลองควรได้รับการจัดการตามแนวทางการกำจัดของเสียทางการแพทย์.
อ้างอิง:
- แนวทางปฏิบัติทางคลินิกของ NCCN ในด้านเนื้องอกวิทยา – แนวทางการรักษามะเร็งปอดชนิดเซลล์ไม่เล็ก (ฉบับภาษาจีน), เวอร์ชัน 1.2009.
- ฮวงเจี๋ย, ฉู่โชวฟาง, และคณะ. การจัดตั้งวัสดุควบคุมการกลายพันธุ์ของยีน EGFR ของมนุษย์. วารสารการวิเคราะห์เภสัชกรรมจีน, 2011, 31(9):1758-1763.
- ฉันทามติของผู้เชี่ยวชาญเกี่ยวกับการตรวจหาการกลายพันธุ์ของยีนของตัวรับปัจจัยการเจริญเติบโตของผิวหนังในผู้ป่วยมะเร็งปอดชนิดไม่เล็กในประเทศจีน. วารสารพยาธิวิทยาจีน, 2011, 40(10).
รีวิว
ยังไม่มีบทวิจารณ์