Kit d'ADN de sol hipure

Aperçu des micro-organismes du sol:

1. Diversité microbienne: Les échantillons de sol contiennent un grand nombre de micro-organismes, dont la plupart ne peuvent pas être directement cultivés pour la recherche.
2. Importance de l'extraction de l'ADN: L'extraction de l'ADN est une méthode cruciale pour étudier ces micro-organismes dans des échantillons de sol.

Méthodes d'extraction d'ADN:

1. Méthode directe:
   • Processus: Implique de placer des échantillons de sol directement dans une solution de lyse et d'utiliser des méthodes mécaniques ou chimiques pour briser les parois cellulaires, libérant ainsi l'ADN microbien dans la solution.
   • Techniques: Comprend des méthodes de rupture de mur pour une lyse efficace; Par exemple, Méthode de Zhou.
   • Avantages: Maximise la probabilité d'obtenir l'ensemble du contenu génomique (métagénome) des micro-organismes du sol.
2. Méthode indirecte:
   • Processus: Commence par la suspension du sol dans une solution tampon (par exemple., Tampon PBS) pour séparer les micro-organismes des particules de sol avant l'extraction de l'ADN.
   • Avantages: Réduit l'impact des inhibiteurs comme les acides humiques et les sels de métaux lourds sur le processus d'extraction de l'ADN.
   • Désavantage: Peut entraîner la perte de nombreux micro-organismes pendant la séparation, et ne récupère généralement pas le métagénome complet.

Défis et considérations:

• Défis de méthode directe: Bien que cela augmente les chances d'obtenir des génomes complets, Cette méthode peut être compromise par la présence d'inhibiteurs tels que les substances humiques et les métaux lourds dans le sol.
• Limitations de méthode indirecte: Moins de chercheurs utilisent cette méthode en raison de son potentiel pour perdre la diversité microbienne et l'exhaustivité de l'extraction génomique.

1. Pollution de l'acide humique.Le sol, surtout dans les forêts et les prairies, est riche en acides humiques. L'acide humique est une série de molécules organiques, dont certains sont très similaires aux molécules d'acide nucléique et difficiles à éliminer pendant la purification. Les traces de pollution de l'acide humique peuvent conduire à des applications en aval telles que RAP et défaillance de la digestion enzymatique.
2. Méthode de lyse.Les échantillons de sol contiennent divers micro-organismes, comme les bactéries et les champignons. Les bactéries et les champignons à Gram Positive contiennent tous deux des murs bactériens très épais, and effectively breaking down the cell walls of these microorganisms is crucial for extracting high-yield metagenomic DNA. Due to the complexity of soil samples, it is not feasible to use enzymatic methods (comme le lysozyme, wall breaking enzyme, snail enzyme) or liquid nitrogen grinding, Comme le sol contient divers métallions ou facteurs inhibiteurs qui inactifs les enzymes digestives, ou la présence de particules de sable dans le sol rend difficile le broyage de l'azote liquide.
3. Le rendement ADN est difficile à contrôler.Les échantillons de sol auraient des changements importants dans le nombre et la variété de micro-organismes dus à la fertilité, infériorité, Haute teneur en humidité, sécheresse, ou profondeur d'échantillonnage. Dans une petite gamme d'échantillons de sol, Le contenu ADN varie souvent par des milliers de fois. En outre, Certains composants chimiques dans le sol, comme les sels de métal lourd et les substances d'argile, peut provoquer une diminution du rendement de l'ADN.

Caractéristiques des kits d'ADN du sol de hipure de Magen:

1. Optimisation:

   • Actuellement, considéré comme le kit le plus optimisé pour l'extraction de l'ADN du sol, fournir des résultats efficaces et fiables.

2. Méthodes d'extraction:

   • Utilise une combinaison de méthodes de broyage de billes de perles en verre et de murs chimiques thermiques.
   • Compatible avec les instruments de vortex point, Éliminer le besoin d'équipements de broyage de perles spécialisées.
   • Convient pour un large éventail de paramètres de laboratoire.

3. Élimination de l'acide humique:

   • Intègre une solution d'absorbeur, Un adsorbant d'acide humique propriétaire développé par Magen.
   • Élimine efficacement divers polluants de l'acide humique des échantillons de sol, Amélioration de la pureté de l'ADN.

4. Élimination des inhibiteurs solubles:

   • Utilise une méthode de purification de la colonne de gel de silice sans alcool pour éliminer les sels métalliques solubles et d'autres facteurs inhibiteurs des échantillons de sol.

5. Application polyvalente:

   • Extrait avec succès l'ADN de divers types de sols, y compris les sols forestiers, mangrove, prairies, terres agricoles, boue du fond marin, boue, terre minérale, et plus.
   • Soutient l'isolement rapide et fiable de l'ADN génomique de haute qualité.

6. Capacité de traitement et temps:

   • Capable de traiter jusqu'à 500 mg d'échantillons de sol à l'intérieur 60 minutes, faciliter les workflows à haut débit.

7. Compatibilité PCR:

   • L'ADN purifié convient à la PCR, digestion des restrictions, et applications de séquençage de nouvelle génération.

8. Efficacité et durabilité:

   • Utilise les propriétés de liaison à l'acide nucléique réversibles de la matrice de hipure combinée avec colonne de rotation Technologie pour éliminer les composés inhibiteurs de PCR comme l'acide humique.
   • Réduit les déchets plastiques et le temps pratique en éliminant le besoin d'extractions organiques, activer le traitement parallèle de plusieurs échantillons.

Caractéristiques

Processus d'extraction de l'ADN du sol:

1. Homogénéisation et lyse:
   • L'échantillon de sol est homogénéisé pour assurer l'uniformité.
   • Il est ensuite traité dans un tampon spécialement formulé contenant un détergent pour lyser efficacement les bactéries, levure, et des échantillons fongiques.
2. Élimination des contaminants:
   • Notre solution d'absorbeur propriétaire élimine efficacement l'acide humique, protéines, polysaccharides, et d'autres contaminants de l'échantillon lysé.
3. Reliure et lavage:
   • L'échantillon lysé subit un ajustement des conditions de liaison et est appliqué à une mini colonne d'ADN.
   • Two rapid wash steps effectively remove trace contaminants, Assurer la pureté.
4. Elution of Purified DNA:
   • Pure DNA is eluted from the column in a low ionic strength buffer.
   • The purified DNA obtained is of high quality and can be directly used in downstream applications without the need for further purification.

Avantages

• Rapide – Plusieurs échantillons peuvent être extraits dans 40 minutes (Après la digestion)
• Haute pureté – L'ADN purifié peut être directement utilisé dans diverses applications en aval
• Bonne répétabilité – la technologie de la silice peut obtenir des résultats idéaux à chaque fois
• Récupération élevée – L'ADN peut être récupéré au niveau du PG

Contenu du kit

Instructions de stockage:

1. Solution d'absorbeur:
   • À l'arrivée, store at 2-8°C.
   • Stockage à court terme (jusqu'à 24 semaines) à température ambiante (15-25°C) n'affecte pas les performances.
2. Composants du kit restant:
   • Stocker les composants secs à température ambiante (15-25°C).
   • Stable pour au moins 18 mois dans ces conditions.

Données d'expérimentation