Kit de ADN del suelo Hipure

Descripción general de los microorganismos del suelo:

1. Diversidad microbiana: Las muestras de suelo contienen una gran cantidad de microorganismos, la mayoría de los cuales no se pueden cultivar directamente para la investigación.
2. Importancia de la extracción de ADN: Extraer el ADN es un método crucial para estudiar estos microorganismos en muestras de suelo.

Métodos de extracción de ADN:

1. Método directo:
   • Proceso: Implica colocar muestras de suelo directamente en una solución de lisis y usar métodos mecánicos o químicos para romper las paredes celulares, liberando así el ADN microbiano en la solución.
   • Técnicas: Incluye métodos de ruptura de pared para una lisis efectiva; Por ejemplo, El método de Zhou.
   • Ventajas: Maximiza la probabilidad de obtener todo el contenido genómico (metagenoma) de microorganismos del suelo.
2. Método indirecto:
   • Proceso: Comienza con suspender el suelo en una solución de amortiguación (p.ej., Búfer PBS) Para separar los microorganismos de las partículas del suelo antes de la extracción de ADN.
   • Ventajas: Reduce el impacto de inhibidores como los ácidos húmicos y las sales de metales pesados ​​en el proceso de extracción de ADN.
   • Desventajas: Puede dar lugar a la pérdida de muchos microorganismos durante la separación, y generalmente no recupera el metagenoma completo.

Desafíos y consideraciones:

• Desafíos de métodos directos: Aunque aumenta las posibilidades de obtener genomas completos, Este método puede verse comprometido por la presencia de inhibidores como sustancias húmicas y metales pesados ​​en el suelo.
• Limitaciones del método indirecto: Menos investigadores usan este método debido a su potencial para perder la diversidad microbiana y la integridad de la extracción genómica.

1. Contaminación del ácido húmico.El suelo, especialmente en bosques y praderas, es rico en ácidos húmicos. El ácido húmico es una serie de moléculas orgánicas, algunos de los cuales son muy similares a las moléculas de ácido nucleico y difíciles de eliminar durante la purificación. Las pequeñas cantidades de contaminación del ácido húmico pueden conducir a aplicaciones posteriores como PCR y falla en la digestión enzimática.
2. Método de lisis.Las muestras de suelo contienen varios microorganismos, como bacterias y hongos. Las bacterias y hongos gram positivos contienen paredes bacterianas muy gruesas, y descomponer efectivamente las paredes celulares de estos microorganismos es crucial para extraer ADN metagenómico de alto rendimiento. Debido a la complejidad de las muestras de suelo, No es factible usar métodos enzimáticos (como lisozima, enzima de ruptura de pared, enzima de caracol) o molienda de nitrógeno líquido, ya que el suelo contiene varios metaliones o factores inhibitorios que inactiva las enzimas digestivas, o la presencia de partículas de arena en el suelo dificulta la molienda de nitrógeno líquido.
3. El rendimiento del ADN es difícil de controlar.Las muestras de suelo tendrían cambios significativos en el número y la variedad de microorganismos debido a la fertilidad, inferioridad, Alto contenido de humedad, sequedad, o profundidad de muestreo. En una pequeña gama de muestras de suelo, El contenido de ADN a menudo varía en miles de veces. Además, ciertos componentes químicos en el suelo, como sales de metales pesados ​​y sustancias de arcilla, puede causar una disminución en el rendimiento del ADN.

Características de los kits de ADN del suelo Hipure de Magen:

1. Mejoramiento:

   • Actualmente, Considerado el kit más optimizado para la extracción de ADN del suelo, proporcionando resultados eficientes y confiables.

2. Métodos de extracción:

   • Utiliza una combinación de molienda de cuentas de vidrio y métodos de ruptura de la pared química de choque térmico.
   • Compatible con Point Vortex Instruments, Eliminando la necesidad de equipos especializados de molienda de cuentas.
   • Adecuado para una amplia gama de entornos de laboratorio.

3. Eliminación de ácido húmico:

   • Incorpora una solución absorbente, un adsorbente de ácido húmico patentado desarrollado por Magen.
   • Elimina eficientemente varios contaminantes de ácido húmico de muestras de suelo, Mejora de la pureza del ADN.

4. Extracción del inhibidor soluble:

   • Emplea un método de purificación de columna de gel de sílice sin alcohol para eliminar sales de metal soluble y otros factores inhibitorios de muestras de suelo.

5. Aplicación versátil:

   • Extrae con éxito el ADN de varios tipos de suelo, incluyendo suelo forestal, suelo de manglar, praderas, tierras de cultivo, barro de lonros marinos, lodo, Suelo del área mineral, y más.
   • Apoya el aislamiento rápido y confiable del ADN genómico de alta calidad.

6. Capacidad de procesamiento y tiempo:

   • Capaz de procesar hasta 500 mg de muestras de suelo dentro 60 minutos, facilitar flujos de trabajo de alto rendimiento.

7. Compatibilidad con PCR:

   • El ADN purificado es adecuado para PCR, digestión de restricción, y aplicaciones de secuenciación de próxima generación.

8. Eficiencia y sostenibilidad:

   • Utiliza las propiedades reversibles de unión al ácido nucleico de la matriz de cadera combinadas con columna de giro tecnología para eliminar compuestos inhibidores de la PCR como el ácido húmico.
   • Reduce los desechos plásticos y el tiempo práctico eliminando la necesidad de extracciones orgánicas, habilitar el procesamiento paralelo de múltiples muestras.

Especificaciones

Proceso de extracción de ADN del suelo:

1. Homogeneización y lisis:
   • La muestra del suelo se homogeneiza para garantizar la uniformidad..
   • Luego se trata en un tampón especialmente formulado que contiene detergente para bacterias de manera efectiva, levadura, y muestras de hongos.
2. Eliminación de contaminantes:
   • Nuestra solución de absorción patentada elimina eficientemente el ácido húmico, proteínas, polisacáridos, y otros contaminantes de la muestra lisada.
3. Atacada y lavado:
   • La muestra lisada sufre ajuste de las condiciones de unión y se aplica a una columna de ADN Mini.
   • Dos pasos de lavado rápido eliminan efectivamente los contaminantes de trazas, Garantizar la pureza.
4. Elución de ADN purificado:
   • El ADN puro se eluye de la columna en un tampón de resistencia iónica baja.
   • El ADN purificado obtenido es de alta calidad y puede usarse directamente en aplicaciones aguas abajo sin la necesidad de una purificación adicional.

Ventajas

• Rápido – Se pueden extraer varias muestras en 40 minutos (después de la digestión)
• Alta pureza – El ADN purificado se puede utilizar directamente en diversas aplicaciones posteriores.
• Buena repetibilidad – La tecnología de sílice puede obtener resultados ideales en todo momento.
• Alta recuperación – El ADN se puede recuperar a nivel de PG

Contenido del kit

Instrucciones de almacenamiento:

1. Solución absorbente:
   • A llegado, almacenar a 2-8 ° C.
   • Almacenamiento a corto plazo (hasta 24 semanas) a temperatura ambiente (15-25°C) no afecta el rendimiento.
2. Componentes del kit restantes:
   • Almacenar componentes secos a temperatura ambiente (15-25°C).
   • Estable por al menos 18 meses en estas condiciones.

Datos del experimento